Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn16Q925N4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn16Q925N4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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