Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Letmd1Q924L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Letmd1Q924L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Letmd1Q924L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Letmd1Q924L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms