Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Csmd1Q923L3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csmd1Q923L3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csmd1Q923L3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csmd1Q923L3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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