Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsqQ91ZF4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsqQ91ZF4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsqQ91ZF4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsqQ91ZF4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsqQ91ZF4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms