Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cd248Q91V98 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Cd248Q91V98 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cd248Q91V98 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cd248Q91V98 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cd248Q91V98 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cd248Q91V98 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Cd248Q91V98 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cd248Q91V98 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,2 ms