Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc71Q8VEG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc71Q8VEG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc71Q8VEG0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc71Q8VEG0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc71Q8VEG0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms