Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx18Q8VDS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx18Q8VDS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx18Q8VDS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms