Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cbx7Q8VDS3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx7Q8VDS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms