Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgsm3Q8VCZ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgsm3Q8VCZ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgsm3Q8VCZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.3 ms