Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx5Q8K1E0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx5Q8K1E0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms