Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip10Q8CJ53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip10Q8CJ53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip10Q8CJ53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms