Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ercc8Q8CFD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc8Q8CFD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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