Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm9955Q8CEJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm9955Q8CEJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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