Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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