Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn3Q8CBC6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrn3Q8CBC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn3Q8CBC6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms