Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc5Q8CAL5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc5Q8CAL5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc5Q8CAL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc5Q8CAL5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms