Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC106179Q8C9L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC106179Q8C9L1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms