Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms