Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20,83■□□□□ 0,93
Ssuh2Q8C3L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ssuh2Q8C3L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ssuh2Q8C3L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms