Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA5

Clptm1l, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1lQ8BXA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1lQ8BXA5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1lQ8BXA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1lQ8BXA5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1lQ8BXA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1lQ8BXA5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clptm1lQ8BXA5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clptm1lQ8BXA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clptm1lQ8BXA5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms