Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pggt1bQ8BUY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pggt1bQ8BUY9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms