Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Ap3s2Q8BSZ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19,65■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,65■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
Ap3s2Q8BSZ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms