Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcal1Q8BJL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcal1Q8BJL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcal1Q8BJL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcal1Q8BJL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms