Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH48

Ubap1, Ubiquitin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1Q8BH48 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubap1Q8BH48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ubap1Q8BH48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubap1Q8BH48 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubap1Q8BH48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubap1Q8BH48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubap1Q8BH48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms