Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4cQ811C2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4cQ811C2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4cQ811C2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4cQ811C2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4cQ811C2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms