Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cct8l1Q80YT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cct8l1Q80YT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cct8l1Q80YT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cct8l1Q80YT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cct8l1Q80YT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct8l1Q80YT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct8l1Q80YT3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cct8l1Q80YT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct8l1Q80YT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms