Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp8Q80YR6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp8Q80YR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8Q80YR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8Q80YR6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp8Q80YR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms