Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm3Q80WV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm3Q80WV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm3Q80WV7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm3Q80WV7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms