Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cul9Q80TT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cul9Q80TT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul9Q80TT8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cul9Q80TT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul9Q80TT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul9Q80TT8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cul9Q80TT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cul9Q80TT8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms