Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cand1Q6ZQ38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cand1Q6ZQ38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cand1Q6ZQ38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cand1Q6ZQ38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms