Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efr3bQ6ZQ18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efr3bQ6ZQ18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efr3bQ6ZQ18 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms