Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbtb39Q6PDK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbtb39Q6PDK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb39Q6PDK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms