Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BcrQ6PAJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcrQ6PAJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BcrQ6PAJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcrQ6PAJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcrQ6PAJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcrQ6PAJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms