Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx6Q6P8X1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx6Q6P8X1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx6Q6P8X1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx6Q6P8X1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms