Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp12Q6P5B0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrp12Q6P5B0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp12Q6P5B0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms