Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pprc1Q6NZN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pprc1Q6NZN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pprc1Q6NZN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Pprc1Q6NZN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pprc1Q6NZN1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pprc1Q6NZN1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms