Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Wdr44Q6NVE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr44Q6NVE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Wdr44Q6NVE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Wdr44Q6NVE8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms