Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem2Q6NVD0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem2Q6NVD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Frem2Q6NVD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms