Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt39Q6IFX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt39Q6IFX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt39Q6IFX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt39Q6IFX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms