Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU2

Klhl23, Kelch-like protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl23Q6GQU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl23Q6GQU2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl23Q6GQU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl23Q6GQU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl23Q6GQU2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms