Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Smarca2Q6DIC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Smarca2Q6DIC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Smarca2Q6DIC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Smarca2Q6DIC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Smarca2Q6DIC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Smarca2Q6DIC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Smarca2Q6DIC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms