Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4bp1Q6A037 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4bp1Q6A037 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4bp1Q6A037 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms