Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs2Q66JT5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs2Q66JT5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs2Q66JT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpgs2Q66JT5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms