Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3bQ62141 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3bQ62141 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sin3bQ62141 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms