Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctr9Q62018 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctr9Q62018 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctr9Q62018 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 988.3 ms