Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccna1Q61456 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccna1Q61456 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccna1Q61456 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccna1Q61456 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccna1Q61456 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms