Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kpna1Q60960 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kpna1Q60960 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kpna1Q60960 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna1Q60960 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms