Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clec4a4Q5YIR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a4Q5YIR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4a4Q5YIR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4a4Q5YIR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms