Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmtk3Q5XJV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk3Q5XJV6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk3Q5XJV6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk3Q5XJV6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmtk3Q5XJV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lmtk3Q5XJV6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmtk3Q5XJV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmtk3Q5XJV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lmtk3Q5XJV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lmtk3Q5XJV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lmtk3Q5XJV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms