Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r196Q5SVD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r196Q5SVD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms